Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Odf1Q61999 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf1Q61999 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf1Q61999 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Odf1Q61999 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Odf1Q61999 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Odf1Q61999 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf1Q61999 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Odf1Q61999 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf1Q61999 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Odf1Q61999 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Odf1Q61999 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Odf1Q61999 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Odf1Q61999 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Odf1Q61999 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Odf1Q61999 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf1Q61999 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Odf1Q61999 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf1Q61999 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf1Q61999 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Odf1Q61999 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf1Q61999 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf1Q61999 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Odf1Q61999 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf1Q61999 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf1Q61999 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf1Q61999 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf1Q61999 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf1Q61999 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Odf1Q61999 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf1Q61999 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf1Q61999 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf1Q61999 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Odf1Q61999 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Odf1Q61999 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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