Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Npm1Q61937 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Npm1Q61937 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Npm1Q61937 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Npm1Q61937 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Npm1Q61937 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Npm1Q61937 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Npm1Q61937 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Npm1Q61937 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Npm1Q61937 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Npm1Q61937 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Npm1Q61937 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Npm1Q61937 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Npm1Q61937 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Npm1Q61937 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Npm1Q61937 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Npm1Q61937 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Npm1Q61937 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Npm1Q61937 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Npm1Q61937 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Npm1Q61937 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Npm1Q61937 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Npm1Q61937 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Npm1Q61937 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms