Protein–RNA interactions for Protein: Q61897

Krt33b, Keratin, type I cuticular Ha3-II, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt33bQ61897 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt33bQ61897 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt33bQ61897 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt33bQ61897 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt33bQ61897 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt33bQ61897 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt33bQ61897 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt33bQ61897 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt33bQ61897 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt33bQ61897 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt33bQ61897 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt33bQ61897 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt33bQ61897 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt33bQ61897 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt33bQ61897 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt33bQ61897 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt33bQ61897 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt33bQ61897 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt33bQ61897 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt33bQ61897 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt33bQ61897 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt33bQ61897 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt33bQ61897 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt33bQ61897 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt33bQ61897 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt33bQ61897 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt33bQ61897 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt33bQ61897 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt33bQ61897 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Krt33bQ61897 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt33bQ61897 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt33bQ61897 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt33bQ61897 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt33bQ61897 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt33bQ61897 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt33bQ61897 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt33bQ61897 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt33bQ61897 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt33bQ61897 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt33bQ61897 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt33bQ61897 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt33bQ61897 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt33bQ61897 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt33bQ61897 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt33bQ61897 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt33bQ61897 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt33bQ61897 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt33bQ61897 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Krt33bQ61897 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt33bQ61897 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Krt33bQ61897 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt33bQ61897 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt33bQ61897 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt33bQ61897 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt33bQ61897 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt33bQ61897 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt33bQ61897 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt33bQ61897 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt33bQ61897 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt33bQ61897 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt33bQ61897 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt33bQ61897 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt33bQ61897 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt33bQ61897 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Krt33bQ61897 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Krt33bQ61897 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt33bQ61897 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt33bQ61897 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt33bQ61897 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt33bQ61897 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Krt33bQ61897 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt33bQ61897 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt33bQ61897 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt33bQ61897 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt33bQ61897 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt33bQ61897 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt33bQ61897 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt33bQ61897 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt33bQ61897 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt33bQ61897 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt33bQ61897 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt33bQ61897 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt33bQ61897 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt33bQ61897 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt33bQ61897 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt33bQ61897 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt33bQ61897 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt33bQ61897 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt33bQ61897 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt33bQ61897 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt33bQ61897 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt33bQ61897 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt33bQ61897 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Krt33bQ61897 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt33bQ61897 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt33bQ61897 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt33bQ61897 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt33bQ61897 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt33bQ61897 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Krt33bQ61897 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms