Protein–RNA interactions for Protein: Q61878

Prg2, Bone marrow proteoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg2Q61878 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prg2Q61878 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prg2Q61878 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prg2Q61878 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prg2Q61878 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prg2Q61878 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prg2Q61878 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prg2Q61878 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prg2Q61878 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prg2Q61878 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prg2Q61878 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prg2Q61878 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prg2Q61878 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prg2Q61878 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prg2Q61878 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prg2Q61878 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prg2Q61878 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prg2Q61878 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prg2Q61878 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prg2Q61878 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prg2Q61878 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prg2Q61878 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prg2Q61878 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prg2Q61878 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prg2Q61878 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Prg2Q61878 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prg2Q61878 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prg2Q61878 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prg2Q61878 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prg2Q61878 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prg2Q61878 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prg2Q61878 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prg2Q61878 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prg2Q61878 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prg2Q61878 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Prg2Q61878 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms