Protein–RNA interactions for Protein: Q61718

Ifna15, Alpha-interferon, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna15Q61718 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ifna15Q61718 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna15Q61718 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ifna15Q61718 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ifna15Q61718 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna15Q61718 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna15Q61718 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna15Q61718 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ifna15Q61718 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna15Q61718 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna15Q61718 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Ifna15Q61718 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna15Q61718 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna15Q61718 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ifna15Q61718 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna15Q61718 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ifna15Q61718 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna15Q61718 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ifna15Q61718 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna15Q61718 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna15Q61718 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna15Q61718 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Ifna15Q61718 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna15Q61718 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna15Q61718 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna15Q61718 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna15Q61718 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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Ifna15Q61718 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Ifna15Q61718 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna15Q61718 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Ifna15Q61718 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna15Q61718 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna15Q61718 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna15Q61718 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna15Q61718 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna15Q61718 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna15Q61718 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna15Q61718 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Ifna15Q61718 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Ifna15Q61718 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna15Q61718 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Ifna15Q61718 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms