Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gli3Q61602 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gli3Q61602 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms