Protein–RNA interactions for Protein: Q61234

Snta1, Alpha-1-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snta1Q61234 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snta1Q61234 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snta1Q61234 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snta1Q61234 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snta1Q61234 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snta1Q61234 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snta1Q61234 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snta1Q61234 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snta1Q61234 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snta1Q61234 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snta1Q61234 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snta1Q61234 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snta1Q61234 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snta1Q61234 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snta1Q61234 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snta1Q61234 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snta1Q61234 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snta1Q61234 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snta1Q61234 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snta1Q61234 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snta1Q61234 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Snta1Q61234 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snta1Q61234 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snta1Q61234 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snta1Q61234 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snta1Q61234 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms