Protein–RNA interactions for Protein: Q61080

Foxf1, Forkhead box protein F1, mousemouse

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxf1Q61080 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Foxf1Q61080 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Foxf1Q61080 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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