Protein–RNA interactions for Protein: Q60974

Ncor1, Nuclear receptor corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncor1Q60974 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ncor1Q60974 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ncor1Q60974 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ncor1Q60974 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ncor1Q60974 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ncor1Q60974 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ncor1Q60974 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ncor1Q60974 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ncor1Q60974 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ncor1Q60974 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ncor1Q60974 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ncor1Q60974 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ncor1Q60974 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ncor1Q60974 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ncor1Q60974 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ncor1Q60974 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ncor1Q60974 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ncor1Q60974 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ncor1Q60974 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ncor1Q60974 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ncor1Q60974 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ncor1Q60974 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ncor1Q60974 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ncor1Q60974 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ncor1Q60974 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ncor1Q60974 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ncor1Q60974 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ncor1Q60974 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ncor1Q60974 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ncor1Q60974 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ncor1Q60974 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ncor1Q60974 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ncor1Q60974 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ncor1Q60974 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ncor1Q60974 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ncor1Q60974 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ncor1Q60974 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ncor1Q60974 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ncor1Q60974 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ncor1Q60974 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ncor1Q60974 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ncor1Q60974 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ncor1Q60974 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms