Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp4Q60972 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp4Q60972 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms