Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Meis1Q60954 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Meis1Q60954 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms