Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Traf3Q60803 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Traf3Q60803 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms