Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klf4Q60793 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Klf4Q60793 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms