Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Atf3Q60765 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atf3Q60765 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms