Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk2a1Q60737 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk2a1Q60737 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms