Protein–RNA interactions for Protein: Q5TIS6

Noto, Homeobox protein notochord, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NotoQ5TIS6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NotoQ5TIS6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NotoQ5TIS6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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