Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Brip1Q5SXJ3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Brip1Q5SXJ3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms