Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW75

Ssh2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh2Q5SW75 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ssh2Q5SW75 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ssh2Q5SW75 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ssh2Q5SW75 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ssh2Q5SW75 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ssh2Q5SW75 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Ssh2Q5SW75 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ssh2Q5SW75 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ssh2Q5SW75 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ssh2Q5SW75 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ssh2Q5SW75 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ssh2Q5SW75 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ssh2Q5SW75 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ssh2Q5SW75 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ssh2Q5SW75 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ssh2Q5SW75 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ssh2Q5SW75 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ssh2Q5SW75 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ssh2Q5SW75 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ssh2Q5SW75 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ssh2Q5SW75 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ssh2Q5SW75 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ssh2Q5SW75 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ssh2Q5SW75 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Ssh2Q5SW75 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ssh2Q5SW75 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ssh2Q5SW75 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ssh2Q5SW75 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ssh2Q5SW75 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ssh2Q5SW75 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Ssh2Q5SW75 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ssh2Q5SW75 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ssh2Q5SW75 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ssh2Q5SW75 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ssh2Q5SW75 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ssh2Q5SW75 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ssh2Q5SW75 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ssh2Q5SW75 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ssh2Q5SW75 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ssh2Q5SW75 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ssh2Q5SW75 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ssh2Q5SW75 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ssh2Q5SW75 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ssh2Q5SW75 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ssh2Q5SW75 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ssh2Q5SW75 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ssh2Q5SW75 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ssh2Q5SW75 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ssh2Q5SW75 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ssh2Q5SW75 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ssh2Q5SW75 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ssh2Q5SW75 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ssh2Q5SW75 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ssh2Q5SW75 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ssh2Q5SW75 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ssh2Q5SW75 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ssh2Q5SW75 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ssh2Q5SW75 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ssh2Q5SW75 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ssh2Q5SW75 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Ssh2Q5SW75 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ssh2Q5SW75 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ssh2Q5SW75 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ssh2Q5SW75 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ssh2Q5SW75 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ssh2Q5SW75 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ssh2Q5SW75 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ssh2Q5SW75 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ssh2Q5SW75 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ssh2Q5SW75 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ssh2Q5SW75 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ssh2Q5SW75 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ssh2Q5SW75 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ssh2Q5SW75 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ssh2Q5SW75 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ssh2Q5SW75 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ssh2Q5SW75 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ssh2Q5SW75 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ssh2Q5SW75 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ssh2Q5SW75 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ssh2Q5SW75 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ssh2Q5SW75 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ssh2Q5SW75 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ssh2Q5SW75 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ssh2Q5SW75 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ssh2Q5SW75 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ssh2Q5SW75 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ssh2Q5SW75 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ssh2Q5SW75 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ssh2Q5SW75 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ssh2Q5SW75 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ssh2Q5SW75 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ssh2Q5SW75 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ssh2Q5SW75 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ssh2Q5SW75 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ssh2Q5SW75 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ssh2Q5SW75 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ssh2Q5SW75 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ssh2Q5SW75 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ssh2Q5SW75 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms