Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc42Q5SV66 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc42Q5SV66 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms