Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Psme4Q5SSW2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Psme4Q5SSW2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms