Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Phf12Q5SPL2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Phf12Q5SPL2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms