Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCY0

Kdm6b, Lysine-specific demethylase 6B, mousemouse

Predictions only

Length 1,641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm6bQ5NCY0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kdm6bQ5NCY0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kdm6bQ5NCY0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kdm6bQ5NCY0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Kdm6bQ5NCY0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Kdm6bQ5NCY0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kdm6bQ5NCY0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kdm6bQ5NCY0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kdm6bQ5NCY0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kdm6bQ5NCY0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kdm6bQ5NCY0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kdm6bQ5NCY0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kdm6bQ5NCY0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kdm6bQ5NCY0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kdm6bQ5NCY0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kdm6bQ5NCY0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Kdm6bQ5NCY0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kdm6bQ5NCY0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kdm6bQ5NCY0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kdm6bQ5NCY0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kdm6bQ5NCY0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Kdm6bQ5NCY0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kdm6bQ5NCY0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kdm6bQ5NCY0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kdm6bQ5NCY0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kdm6bQ5NCY0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kdm6bQ5NCY0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kdm6bQ5NCY0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kdm6bQ5NCY0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kdm6bQ5NCY0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kdm6bQ5NCY0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kdm6bQ5NCY0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Kdm6bQ5NCY0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kdm6bQ5NCY0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kdm6bQ5NCY0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kdm6bQ5NCY0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kdm6bQ5NCY0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kdm6bQ5NCY0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kdm6bQ5NCY0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Kdm6bQ5NCY0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Kdm6bQ5NCY0 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Kdm6bQ5NCY0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Kdm6bQ5NCY0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kdm6bQ5NCY0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kdm6bQ5NCY0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kdm6bQ5NCY0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Kdm6bQ5NCY0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Kdm6bQ5NCY0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Kdm6bQ5NCY0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Kdm6bQ5NCY0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Kdm6bQ5NCY0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Kdm6bQ5NCY0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Kdm6bQ5NCY0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Kdm6bQ5NCY0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kdm6bQ5NCY0 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kdm6bQ5NCY0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kdm6bQ5NCY0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kdm6bQ5NCY0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kdm6bQ5NCY0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kdm6bQ5NCY0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kdm6bQ5NCY0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kdm6bQ5NCY0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kdm6bQ5NCY0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kdm6bQ5NCY0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Kdm6bQ5NCY0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Kdm6bQ5NCY0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Kdm6bQ5NCY0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Kdm6bQ5NCY0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Kdm6bQ5NCY0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Kdm6bQ5NCY0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Kdm6bQ5NCY0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Kdm6bQ5NCY0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Kdm6bQ5NCY0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Kdm6bQ5NCY0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Kdm6bQ5NCY0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Kdm6bQ5NCY0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Kdm6bQ5NCY0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Kdm6bQ5NCY0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Kdm6bQ5NCY0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Kdm6bQ5NCY0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Kdm6bQ5NCY0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Kdm6bQ5NCY0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Kdm6bQ5NCY0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Kdm6bQ5NCY0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Kdm6bQ5NCY0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Kdm6bQ5NCY0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Kdm6bQ5NCY0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Kdm6bQ5NCY0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Kdm6bQ5NCY0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Kdm6bQ5NCY0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kdm6bQ5NCY0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kdm6bQ5NCY0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kdm6bQ5NCY0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Kdm6bQ5NCY0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kdm6bQ5NCY0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kdm6bQ5NCY0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kdm6bQ5NCY0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kdm6bQ5NCY0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kdm6bQ5NCY0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Kdm6bQ5NCY0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms