Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC48

Gm12253, Predicted gene 12253, mousemouse

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12253Q5NC48 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm12253Q5NC48 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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