Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBX1

Cobl, Protein cordon-bleu, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CoblQ5NBX1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CoblQ5NBX1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CoblQ5NBX1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms