Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vps41Q5KU39 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vps41Q5KU39 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vps41Q5KU39 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Vps41Q5KU39 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vps41Q5KU39 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vps41Q5KU39 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vps41Q5KU39 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Vps41Q5KU39 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vps41Q5KU39 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vps41Q5KU39 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vps41Q5KU39 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vps41Q5KU39 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vps41Q5KU39 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vps41Q5KU39 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vps41Q5KU39 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vps41Q5KU39 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vps41Q5KU39 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vps41Q5KU39 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vps41Q5KU39 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vps41Q5KU39 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vps41Q5KU39 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vps41Q5KU39 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vps41Q5KU39 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vps41Q5KU39 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vps41Q5KU39 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vps41Q5KU39 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vps41Q5KU39 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vps41Q5KU39 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vps41Q5KU39 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vps41Q5KU39 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vps41Q5KU39 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vps41Q5KU39 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vps41Q5KU39 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vps41Q5KU39 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vps41Q5KU39 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vps41Q5KU39 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vps41Q5KU39 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vps41Q5KU39 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vps41Q5KU39 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vps41Q5KU39 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vps41Q5KU39 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vps41Q5KU39 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vps41Q5KU39 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vps41Q5KU39 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vps41Q5KU39 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vps41Q5KU39 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Vps41Q5KU39 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vps41Q5KU39 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vps41Q5KU39 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Vps41Q5KU39 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vps41Q5KU39 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms