Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SynaQ5G5D5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SynaQ5G5D5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SynaQ5G5D5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SynaQ5G5D5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SynaQ5G5D5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SynaQ5G5D5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SynaQ5G5D5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SynaQ5G5D5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SynaQ5G5D5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SynaQ5G5D5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SynaQ5G5D5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SynaQ5G5D5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SynaQ5G5D5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SynaQ5G5D5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SynaQ5G5D5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SynaQ5G5D5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SynaQ5G5D5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SynaQ5G5D5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SynaQ5G5D5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SynaQ5G5D5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SynaQ5G5D5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SynaQ5G5D5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SynaQ5G5D5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SynaQ5G5D5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SynaQ5G5D5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SynaQ5G5D5 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SynaQ5G5D5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SynaQ5G5D5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SynaQ5G5D5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SynaQ5G5D5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SynaQ5G5D5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SynaQ5G5D5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SynaQ5G5D5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SynaQ5G5D5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SynaQ5G5D5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SynaQ5G5D5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SynaQ5G5D5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SynaQ5G5D5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SynaQ5G5D5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SynaQ5G5D5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SynaQ5G5D5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SynaQ5G5D5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SynaQ5G5D5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SynaQ5G5D5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SynaQ5G5D5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SynaQ5G5D5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SynaQ5G5D5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SynaQ5G5D5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SynaQ5G5D5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SynaQ5G5D5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SynaQ5G5D5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms