Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Trpm3Q5F4S9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trpm3Q5F4S9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms