Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTU0

Afap1l2, Actin filament-associated protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afap1l2Q5DTU0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Afap1l2Q5DTU0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Afap1l2Q5DTU0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms