Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Spire1Q52KF3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spire1Q52KF3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms