Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccnl1Q52KE7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccnl1Q52KE7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms