Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shank3Q4ACU6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shank3Q4ACU6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shank3Q4ACU6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Shank3Q4ACU6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Shank3Q4ACU6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Shank3Q4ACU6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shank3Q4ACU6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shank3Q4ACU6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shank3Q4ACU6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shank3Q4ACU6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Shank3Q4ACU6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shank3Q4ACU6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Shank3Q4ACU6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shank3Q4ACU6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Shank3Q4ACU6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shank3Q4ACU6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shank3Q4ACU6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shank3Q4ACU6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shank3Q4ACU6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shank3Q4ACU6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Shank3Q4ACU6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shank3Q4ACU6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shank3Q4ACU6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Shank3Q4ACU6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shank3Q4ACU6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shank3Q4ACU6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shank3Q4ACU6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Shank3Q4ACU6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shank3Q4ACU6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shank3Q4ACU6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shank3Q4ACU6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shank3Q4ACU6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shank3Q4ACU6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Shank3Q4ACU6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shank3Q4ACU6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shank3Q4ACU6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Shank3Q4ACU6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shank3Q4ACU6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shank3Q4ACU6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shank3Q4ACU6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shank3Q4ACU6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shank3Q4ACU6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shank3Q4ACU6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shank3Q4ACU6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shank3Q4ACU6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shank3Q4ACU6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Shank3Q4ACU6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shank3Q4ACU6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shank3Q4ACU6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shank3Q4ACU6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shank3Q4ACU6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shank3Q4ACU6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Shank3Q4ACU6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Shank3Q4ACU6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms