Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H9

Samd5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd5Q3V1H9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Samd5Q3V1H9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Samd5Q3V1H9 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Samd5Q3V1H9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Samd5Q3V1H9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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Samd5Q3V1H9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Samd5Q3V1H9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Samd5Q3V1H9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Samd5Q3V1H9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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