Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYK3

Tbc1d9, TBC1 domain family member 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d9Q3UYK3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tbc1d9Q3UYK3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tbc1d9Q3UYK3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tbc1d9Q3UYK3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tbc1d9Q3UYK3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tbc1d9Q3UYK3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tbc1d9Q3UYK3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tbc1d9Q3UYK3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tbc1d9Q3UYK3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tbc1d9Q3UYK3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tbc1d9Q3UYK3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tbc1d9Q3UYK3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tbc1d9Q3UYK3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tbc1d9Q3UYK3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tbc1d9Q3UYK3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tbc1d9Q3UYK3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tbc1d9Q3UYK3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tbc1d9Q3UYK3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tbc1d9Q3UYK3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tbc1d9Q3UYK3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tbc1d9Q3UYK3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tbc1d9Q3UYK3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tbc1d9Q3UYK3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tbc1d9Q3UYK3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tbc1d9Q3UYK3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tbc1d9Q3UYK3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tbc1d9Q3UYK3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tbc1d9Q3UYK3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tbc1d9Q3UYK3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tbc1d9Q3UYK3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tbc1d9Q3UYK3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tbc1d9Q3UYK3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tbc1d9Q3UYK3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tbc1d9Q3UYK3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tbc1d9Q3UYK3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tbc1d9Q3UYK3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tbc1d9Q3UYK3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tbc1d9Q3UYK3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms