Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU41

Scimp, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScimpQ3UU41 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ScimpQ3UU41 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ScimpQ3UU41 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms