Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Fchsd2Q3USJ8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Fchsd2Q3USJ8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms