Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nhlrc4Q3UP44 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nhlrc4Q3UP44 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms