Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nlrc4Q3UP24 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nlrc4Q3UP24 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nlrc4Q3UP24 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nlrc4Q3UP24 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nlrc4Q3UP24 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nlrc4Q3UP24 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nlrc4Q3UP24 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nlrc4Q3UP24 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nlrc4Q3UP24 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nlrc4Q3UP24 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nlrc4Q3UP24 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nlrc4Q3UP24 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nlrc4Q3UP24 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nlrc4Q3UP24 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nlrc4Q3UP24 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nlrc4Q3UP24 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nlrc4Q3UP24 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nlrc4Q3UP24 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nlrc4Q3UP24 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Nlrc4Q3UP24 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nlrc4Q3UP24 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nlrc4Q3UP24 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nlrc4Q3UP24 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms