Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULM0

Ccdc106, Coiled-coil domain-containing protein 106, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc106Q3ULM0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc106Q3ULM0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc106Q3ULM0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms