Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Usp19Q3UJD6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Usp19Q3UJD6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms