Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rrp36Q3UFY0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp36Q3UFY0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms