Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnft2Q3UF64 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms