Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Puf60Q3UEB3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Puf60Q3UEB3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Puf60Q3UEB3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms