Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3U6N9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3U6N9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3U6N9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3U6N9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3U6N9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Q3U6N9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q3U6N9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3U6N9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3U6N9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Q3U6N9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3U6N9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3U6N9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3U6N9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3U6N9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3U6N9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Q3U6N9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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