Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZA2

Cdkl4, Cyclin-dependent kinase-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl4Q3TZA2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkl4Q3TZA2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkl4Q3TZA2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkl4Q3TZA2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkl4Q3TZA2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkl4Q3TZA2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkl4Q3TZA2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkl4Q3TZA2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkl4Q3TZA2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkl4Q3TZA2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkl4Q3TZA2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkl4Q3TZA2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkl4Q3TZA2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkl4Q3TZA2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkl4Q3TZA2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkl4Q3TZA2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdkl4Q3TZA2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkl4Q3TZA2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkl4Q3TZA2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkl4Q3TZA2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkl4Q3TZA2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkl4Q3TZA2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkl4Q3TZA2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkl4Q3TZA2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkl4Q3TZA2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkl4Q3TZA2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkl4Q3TZA2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkl4Q3TZA2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkl4Q3TZA2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdkl4Q3TZA2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkl4Q3TZA2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkl4Q3TZA2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkl4Q3TZA2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkl4Q3TZA2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkl4Q3TZA2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkl4Q3TZA2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkl4Q3TZA2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkl4Q3TZA2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkl4Q3TZA2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkl4Q3TZA2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkl4Q3TZA2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdkl4Q3TZA2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cdkl4Q3TZA2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cdkl4Q3TZA2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdkl4Q3TZA2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdkl4Q3TZA2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdkl4Q3TZA2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdkl4Q3TZA2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdkl4Q3TZA2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdkl4Q3TZA2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdkl4Q3TZA2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdkl4Q3TZA2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdkl4Q3TZA2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdkl4Q3TZA2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdkl4Q3TZA2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdkl4Q3TZA2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdkl4Q3TZA2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdkl4Q3TZA2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkl4Q3TZA2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkl4Q3TZA2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkl4Q3TZA2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkl4Q3TZA2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkl4Q3TZA2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkl4Q3TZA2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkl4Q3TZA2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkl4Q3TZA2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkl4Q3TZA2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkl4Q3TZA2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkl4Q3TZA2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkl4Q3TZA2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkl4Q3TZA2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkl4Q3TZA2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cdkl4Q3TZA2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkl4Q3TZA2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkl4Q3TZA2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkl4Q3TZA2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkl4Q3TZA2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkl4Q3TZA2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkl4Q3TZA2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkl4Q3TZA2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkl4Q3TZA2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkl4Q3TZA2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkl4Q3TZA2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkl4Q3TZA2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkl4Q3TZA2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkl4Q3TZA2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkl4Q3TZA2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkl4Q3TZA2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkl4Q3TZA2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cdkl4Q3TZA2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkl4Q3TZA2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkl4Q3TZA2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkl4Q3TZA2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkl4Q3TZA2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkl4Q3TZA2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkl4Q3TZA2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkl4Q3TZA2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkl4Q3TZA2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkl4Q3TZA2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdkl4Q3TZA2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms