Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Q3TTJ4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q3TTJ4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q3TTJ4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q3TTJ4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q3TTJ4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q3TTJ4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q3TTJ4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Q3TTJ4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q3TTJ4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q3TTJ4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q3TTJ4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q3TTJ4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q3TTJ4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q3TTJ4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3TTJ4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3TTJ4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3TTJ4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3TTJ4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3TTJ4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3TTJ4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3TTJ4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3TTJ4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3TTJ4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3TTJ4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3TTJ4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3TTJ4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q3TTJ4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3TTJ4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3TTJ4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3TTJ4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3TTJ4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3TTJ4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3TTJ4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3TTJ4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3TTJ4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q3TTJ4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms