Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKY6

Cwc27, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CWC27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc27Q3TKY6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cwc27Q3TKY6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cwc27Q3TKY6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cwc27Q3TKY6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cwc27Q3TKY6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cwc27Q3TKY6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cwc27Q3TKY6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cwc27Q3TKY6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cwc27Q3TKY6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cwc27Q3TKY6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cwc27Q3TKY6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cwc27Q3TKY6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cwc27Q3TKY6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cwc27Q3TKY6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cwc27Q3TKY6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cwc27Q3TKY6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cwc27Q3TKY6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cwc27Q3TKY6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cwc27Q3TKY6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cwc27Q3TKY6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cwc27Q3TKY6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cwc27Q3TKY6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cwc27Q3TKY6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cwc27Q3TKY6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cwc27Q3TKY6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cwc27Q3TKY6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cwc27Q3TKY6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cwc27Q3TKY6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cwc27Q3TKY6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cwc27Q3TKY6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cwc27Q3TKY6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cwc27Q3TKY6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cwc27Q3TKY6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cwc27Q3TKY6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cwc27Q3TKY6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cwc27Q3TKY6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cwc27Q3TKY6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cwc27Q3TKY6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cwc27Q3TKY6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cwc27Q3TKY6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cwc27Q3TKY6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cwc27Q3TKY6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cwc27Q3TKY6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cwc27Q3TKY6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cwc27Q3TKY6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Cwc27Q3TKY6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cwc27Q3TKY6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cwc27Q3TKY6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cwc27Q3TKY6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cwc27Q3TKY6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cwc27Q3TKY6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cwc27Q3TKY6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cwc27Q3TKY6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cwc27Q3TKY6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cwc27Q3TKY6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cwc27Q3TKY6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cwc27Q3TKY6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cwc27Q3TKY6 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cwc27Q3TKY6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cwc27Q3TKY6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cwc27Q3TKY6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cwc27Q3TKY6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cwc27Q3TKY6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cwc27Q3TKY6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cwc27Q3TKY6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cwc27Q3TKY6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cwc27Q3TKY6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cwc27Q3TKY6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cwc27Q3TKY6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cwc27Q3TKY6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cwc27Q3TKY6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cwc27Q3TKY6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cwc27Q3TKY6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cwc27Q3TKY6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cwc27Q3TKY6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cwc27Q3TKY6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cwc27Q3TKY6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cwc27Q3TKY6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cwc27Q3TKY6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cwc27Q3TKY6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cwc27Q3TKY6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cwc27Q3TKY6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cwc27Q3TKY6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cwc27Q3TKY6 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cwc27Q3TKY6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cwc27Q3TKY6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cwc27Q3TKY6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cwc27Q3TKY6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cwc27Q3TKY6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cwc27Q3TKY6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cwc27Q3TKY6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cwc27Q3TKY6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cwc27Q3TKY6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cwc27Q3TKY6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cwc27Q3TKY6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cwc27Q3TKY6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cwc27Q3TKY6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cwc27Q3TKY6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cwc27Q3TKY6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cwc27Q3TKY6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms