Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC33

Ccdc127, Coiled-coil domain-containing protein 127, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc127Q3TC33 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc127Q3TC33 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc127Q3TC33 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc127Q3TC33 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc127Q3TC33 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc127Q3TC33 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc127Q3TC33 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc127Q3TC33 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc127Q3TC33 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc127Q3TC33 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc127Q3TC33 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc127Q3TC33 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc127Q3TC33 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc127Q3TC33 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc127Q3TC33 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc127Q3TC33 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc127Q3TC33 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc127Q3TC33 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc127Q3TC33 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc127Q3TC33 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc127Q3TC33 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc127Q3TC33 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc127Q3TC33 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc127Q3TC33 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc127Q3TC33 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms