Protein–RNA interactions for Protein: Q30KN3

Defb33, Beta-defensin 33, mousemouse

Predictions only

Length 62 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb33Q30KN3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defb33Q30KN3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms