Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Shroom4Q1W617 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
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Shroom4Q1W617 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
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Shroom4Q1W617 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Shroom4Q1W617 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Shroom4Q1W617 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Shroom4Q1W617 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Shroom4Q1W617 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Shroom4Q1W617 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Shroom4Q1W617 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Shroom4Q1W617 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Shroom4Q1W617 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Shroom4Q1W617 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
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Shroom4Q1W617 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Shroom4Q1W617 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Shroom4Q1W617 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms