Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cers3Q1A3B0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cers3Q1A3B0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
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